docs: 文档优化完成

docs/context/system-prompt.mdx

@@ -1,36 +1,225 @@
 ---
 title: "System Prompt 动态组装 - AI 工作记忆构建"
-description: "深入解析 Claude Code 的 System Prompt 动态组装过程：如何将 CLAUDE.md、项目上下文、工具定义和用户偏好拼装为 AI 的工作记忆。"
-keywords: ["System Prompt", "系统提示词", "动态组装", "CLAUDE.md", "上下文构建"]
+description: "深入解析 Claude Code 的 System Prompt 动态组装过程：缓存策略、分界标记、Section 注册表、CLAUDE.md 多级合并，以及如何将零散上下文拼装为 API 可消费的缓存友好结构。"
+keywords: ["System Prompt", "系统提示词", "动态组装", "CLAUDE.md", "Prompt Cache", "缓存策略"]
 ---
 
-{/* 本章目标：解释 System Prompt 的组装过程和设计思想 */}
+## 从数组到 API 调用：System Prompt 的完整链路
 
-## 什么是 System Prompt
+System Prompt 在 Claude Code 中不是一段写死的文本，而是一个 **`string[]` 数组**（品牌类型 `SystemPrompt`，定义于 `src/utils/systemPromptType.ts:8`），经过组装、分块、缓存标记后发送给 API。
 
-每次调用 AI API 时，都需要发送一个 System Prompt——它是 AI 的"人设说明书"，告诉 AI：
+### 三阶段管道
 
-- 你是谁（Claude Code，一个编程助手）
-- 你能做什么（可用工具列表）
-- 你在什么环境（操作系统、当前目录、git 状态）
-- 你需要遵守什么规则（安全规范、输出格式）
+```
+getSystemPrompt()          →  string[]       （组装内容）
+  ↓
+buildEffectiveSystemPrompt() →  SystemPrompt   （选择优先级路径）
+  ↓
+buildSystemPromptBlocks()  →  TextBlockParam[] （分块 + cache_control 标记）
+```
+
+1. **`getSystemPrompt()`**（`src/constants/prompts.ts:444`）—— 收集静态段 + 动态段，插入 `SYSTEM_PROMPT_DYNAMIC_BOUNDARY` 分界标记
+2. **`buildEffectiveSystemPrompt()`**（`src/utils/systemPrompt.ts:41`）—— 按 Override > Coordinator > Agent > Custom > Default 优先级选择
+3. **`buildSystemPromptBlocks()`**（`src/services/api/claude.ts:3214`）—— 调用 `splitSysPromptPrefix()` 分块，为每个块附加 `cache_control`
+
+## SystemPrompt 品牌类型
+
+```typescript
+// src/utils/systemPromptType.ts:8
+export type SystemPrompt = readonly string[] & {
+  readonly __brand: 'SystemPrompt'
+}
+export function asSystemPrompt(value: readonly string[]): SystemPrompt {
+  return value as SystemPrompt  // 零开销类型断言
+}
+```
+
+品牌类型（branded type）防止普通 `string[]` 被意外传入 API 调用——只有通过 `asSystemPrompt()` 显式转换才能获得 `SystemPrompt` 类型。
+
+## getSystemPrompt()：内容组装的全景
+
+`src/constants/prompts.ts:444` 是 System Prompt 的核心工厂函数，返回一个有序数组：
+
+| 阶段 | 内容 | 缓存策略 |
+|------|------|----------|
+| **静态区** | Intro Section、System Rules、Doing Tasks、Actions、Using Tools、Tone & Style、Output Efficiency | 可跨组织缓存（`scope: 'global'`） |
+| **BOUNDARY** | `SYSTEM_PROMPT_DYNAMIC_BOUNDARY = '__SYSTEM_PROMPT_DYNAMIC_BOUNDARY__'` | 分界标记（不发送给 API） |
+| **动态区** | Session Guidance、Memory、Model Override、Env Info、Language、Output Style、MCP Instructions、Scratchpad、FRC、Summarize Tool Results、Token Budget、Brief | 每次会话不同（`scope: 'org'` 或无缓存） |
+
+### 动态区的 Section 注册表
+
+动态区通过 `systemPromptSection()` / `DANGEROUS_uncachedSystemPromptSection()` 注册，这两个工厂函数定义于 `src/constants/systemPromptSections.ts`：
+
+```typescript
+// 缓存式 Section：计算一次，/clear 或 /compact 后才重新计算
+systemPromptSection('memory', () => loadMemoryPrompt())
+
+// 危险：每轮重新计算，会破坏 Prompt Cache
+DANGEROUS_uncachedSystemPromptSection(
+  'mcp_instructions',
+  () => isMcpInstructionsDeltaEnabled() ? null : getMcpInstructionsSection(mcpClients),
+  'MCP servers connect/disconnect between turns'  // 必须给出破坏缓存的理由
+)
+```
+
+`resolveSystemPromptSections()` 在每轮查询时解析所有 Section，对于 `cacheBreak: false` 的 Section，优先使用 `getSystemPromptSectionCache()` 中的缓存值。只有 MCP 指令等真正动态的内容使用 `DANGEROUS_uncachedSystemPromptSection`。
+
+### `CLAUDE_CODE_SIMPLE` 快速路径
+
+当环境变量 `CLAUDE_CODE_SIMPLE` 为真时，整个 System Prompt 缩减为一行：
+
+```typescript
+`You are Claude Code, Anthropic's official CLI for Claude.\n\nCWD: ${getCwd()}\nDate: ${getSessionStartDate()}`
+```
+
+跳过所有 Section 注册、缓存分块、动态组装——用于最小化 token 消耗的测试场景。
+
+## buildEffectiveSystemPrompt()：五级优先级
+
+`src/utils/systemPrompt.ts:41` 决定最终使用哪个 System Prompt：
+
+| 优先级 | 条件 | 行为 |
+|--------|------|------|
+| **0. Override** | `overrideSystemPrompt` 非空 | 完全替换，返回 `[override]` |
+| **1. Coordinator** | `COORDINATOR_MODE` feature + 环境变量 | 使用协调者专用提示词 |
+| **2. Agent** | `mainThreadAgentDefinition` 存在 | Proactive 模式：追加到默认提示词尾部；否则：替换默认提示词 |
+| **3. Custom** | `--system-prompt` 参数指定 | 替换默认提示词 |
+| **4. Default** | 无特殊条件 | 使用 `getSystemPrompt()` 完整输出 |
+
+`appendSystemPrompt` 始终追加到末尾（Override 除外）。
+
+## 缓存策略：分块、标记、命中
+
+这是 System Prompt 设计中最精密的部分。
+
+### Anthropic Prompt Cache 基础
+
+Anthropic API 的 Prompt Cache 允许跨请求复用相同的 System Prompt 前缀，按缓存命中量计费（远低于完整输入价格）。缓存键由内容的 Blake2b 哈希决定——任何字符变化都会导致缓存失效。
+
+### `splitSysPromptPrefix()`：三种分块模式
+
+`src/utils/api.ts:321` 是缓存策略的核心，根据条件选择三种分块模式：
+
+#### 模式 1：MCP 工具存在时（`skipGlobalCacheForSystemPrompt=true`）
+
+```
+[attribution header]    → cacheScope: null     （不缓存）
+[system prompt prefix]  → cacheScope: 'org'    （组织级缓存）
+[everything else]       → cacheScope: 'org'    （组织级缓存）
+```
+
+MCP 工具列表在会话中可能变化（连接/断开），破坏了跨组织缓存的基础，因此降级为组织级。
+
+#### 模式 2：Global Cache + Boundary 存在（1P 专用）
 
-## 不是静态模板，而是动态组装
+```
+[attribution header]    → cacheScope: null     （不缓存）
+[system prompt prefix]  → cacheScope: null     （不缓存）
+[static content]        → cacheScope: 'global' （全局缓存！跨组织共享）
+[dynamic content]       → cacheScope: null     （不缓存）
+```
+
+这是缓存效率最高的模式。`SYSTEM_PROMPT_DYNAMIC_BOUNDARY` 之前的静态内容（Intro、Rules、Tone & Style 等）对所有用户相同，可跨组织缓存。
+
+#### 模式 3：默认（3P 提供商 或 Boundary 缺失）
+
+```
+[attribution header]    → cacheScope: null     （不缓存）
+[system prompt prefix]  → cacheScope: 'org'    （组织级缓存）
+[everything else]       → cacheScope: 'org'    （组织级缓存）
+```
+
+### `getCacheControl()`：TTL 决策
 
-Claude Code 的 System Prompt 不是一段写死的文本，而是根据当前环境**实时组装**的：
+`src/services/api/claude.ts:359` 生成的 `cache_control` 对象：
+
+```typescript
+{
+  type: 'ephemeral',
+  ttl?: '1h',         // 仅特定 querySource 符合条件时
+  scope?: 'global',   // 仅静态区
+}
+```
+
+1 小时 TTL 的判定逻辑（`should1hCacheTTL()`，第 394 行）：
+- **Bedrock 用户**：通过环境变量 `ENABLE_PROMPT_CACHING_1H_BEDROCK` 启用
+- **1P 用户**：通过 GrowthBook 配置的 `allowlist` 数组匹配 `querySource`，支持前缀通配符（如 `"repl_main_thread*"`）
+- **会话级锁定**：资格判定结果在 bootstrap state 中缓存，防止 GrowthBook 配置中途变化导致同一会话内 TTL 不一致
+
+### 缓存破坏：Session-Specific Guidance 的放置
+
+`getSessionSpecificGuidanceSection()`（`src/constants/prompts.ts:352`）的内容必须放在 `SYSTEM_PROMPT_DYNAMIC_BOUNDARY` **之后**。因为它包含：
+- 当前会话的 enabledTools 集合
+- `isForkSubagentEnabled()` 的运行时判定
+- `getIsNonInteractiveSession()` 的结果
+
+这些运行时 bit 如果放在静态区，会产生 2^N 种 Blake2b 哈希变体（N = 运行时条件数），完全破坏缓存命中率。源码注释明确警告：
+
+> Each conditional here is a runtime bit that would otherwise multiply the Blake2b prefix hash variants (2^N). See PR #24490, #24171 for the same bug class.
+
+### `CLAUDE_CODE_SIMPLE` 模式
+
+当设置了 `CLAUDE_CODE_SIMPLE` 环境变量时，整个系统提示词会大幅缩减：
+
+```typescript
+return [`You are Claude Code, Anthropic's official CLI for Claude.\n\nCWD: ${getCwd()}\nDate: ${getSessionStartDate()}`]
+```
 
-<Frame caption="System Prompt 的 6 大组成部分">
-  <img src="/docs/images/system-prompt-assembly.png" alt="System Prompt 动态组装图" />
-</Frame>
+## 上下文注入：System Context 与 User Context
 
-| 组成部分 | 内容 | 来源 |
-|----------|------|------|
-| 基础人设 | 角色定义、行为准则 | 内置模板 |
-| 环境信息 | 操作系统、shell 类型、当前日期 | 运行时检测 |
-| Git 状态 | 当前分支、最近提交、工作区状态 | `git` 命令输出 |
-| 项目知识 | CLAUDE.md 文件内容 | 项目目录层级扫描 |
-| 记忆文件 | 用户偏好、项目约定 | 持久化记忆系统 |
-| 工具说明 | 每个可用工具的描述和参数 | 工具注册表 |
+System Prompt 数组本身不包含运行时上下文（git 状态、CLAUDE.md 内容）。上下文通过两个独立的管道注入：
+
+### System Context（`src/context.ts:116`）
+
+```typescript
+export const getSystemContext = memoize(async () => {
+  return {
+    gitStatus,           // git 分支、状态、最近提交（截断至 MAX_STATUS_CHARS=2000）
+    cacheBreaker,        // 仅 ant 用户的缓存破坏器
+  }
+})
+```
+
+- 使用 `lodash.memoize` 缓存——**整个会话期间只计算一次**
+- Git 状态快照包含 5 个并行 `git` 命令（branch、defaultBranch、status、log、userName）
+- `status` 超过 2000 字符时截断并附加提示使用 BashTool 获取更多信息
+- `systemPromptInjection` 变更时，通过 `getUserContext.cache.clear?.()` 清除所有上下文缓存
+
+### User Context（`src/context.ts:155`）
+
+```typescript
+export const getUserContext = memoize(async () => {
+  return {
+    claudeMd,            // 合并后的 CLAUDE.md 内容
+    currentDate,         // "Today's date is YYYY-MM-DD."
+  }
+})
+```
+
+- **CLAUDE.md 禁用条件**：`CLAUDE_CODE_DISABLE_CLAUDE_MDS` 环境变量，或 `--bare` 模式（除非通过 `--add-dir` 显式指定目录）
+- `--bare` 模式的语义是"跳过我没要求的东西"而非"忽略所有"
+
+### 注入位置
+
+在 `src/query.ts:449`：
+
+```typescript
+// System Context 追加到 System Prompt 尾部
+const fullSystemPrompt = asSystemPrompt(
+  appendSystemContext(systemPrompt, systemContext)  // 简单拼接
+)
+```
+
+User Context 通过 `prependUserContext()`（`src/utils/api.ts:449`）注入为 `<system-reminder>` 标签包裹的首条用户消息，放在所有对话消息之前。
+
+## Attribution Header：计费与安全
+
+每个 API 请求的 System Prompt 首块是 Attribution Header（`src/constants/system.ts:30`），包含：
+- **`cc_version`**：Claude Code 版本 + 指纹
+- **`cc_entrypoint`**：入口点标识（REPL / SDK / pipe 等）
+- **`cch=00000`**（NATIVE_CLIENT_ATTESTATION 启用时）：Bun 原生 HTTP 层在发送前将零替换为计算出的哈希值，服务器验证此 token 确认请求来自真实 Claude Code 客户端
+
+Header 始终 `cacheScope: null`——它因版本和指纹不同而变化，不适合缓存。
 
 ## CLAUDE.md：项目级知识注入
 
@@ -49,10 +238,15 @@ Claude Code 的 System Prompt 不是一段写死的文本，而是根据当前
         └── /project/src/CLAUDE.md  ← 子目录（模块特定）
 ```
 
-## 缓存策略
+加载逻辑在 `src/utils/claudemd.ts` 中的 `getClaudeMds()` 和 `getMemoryFiles()` 实现——从 CWD 向上遍历目录树，合并所有匹配的 CLAUDE.md 文件内容。
+
+## 设计洞察：为什么是 `string[]` 而非单个 `string`
+
+将 System Prompt 设计为数组而非单段文本，是为了 **缓存分块**：
 
-System Prompt 的 token 消耗不小（可能占总量的 30%+）。为了降低成本，系统使用了缓存机制：
+1. Anthropic Prompt Cache 以 **内容块**（TextBlock）为缓存单位
+2. 将 System Prompt 拆为多个块，可以让不变的部分（Intro、Rules）获得独立的缓存命中
+3. 如果是单个 `string`，任何一个字符变化（如日期更新）都会导致整个 System Prompt 的缓存失效
+4. `SYSTEM_PROMPT_DYNAMIC_BOUNDARY` 标记允许 `splitSysPromptPrefix()` 精确地将静态区标记为 `scope: 'global'`，动态区不标记或标记为 `scope: 'org'`
 
-- 不变的部分（基础人设、工具说明）可以跨请求复用
-- 变化的部分（git 状态、记忆文件）每次重新生成
-- 缓存节点的位置经过精心设计，最大化缓存命中率
+这是 Claude Code 在 token 成本优化上的核心设计——一次典型的 System Prompt 约 20K+ tokens，通过缓存分块可以节省 30-50% 的输入 token 费用。

docs/conversation/the-loop.mdx

@@ -1,69 +1,182 @@
 ---
 title: "Agentic Loop：AI 自主循环的核心机制"
-description: "深入解析 Claude Code 的 Agentic Loop 机制——AI 如何通过思考-行动-观察的循环，自主决策工具调用链，直到任务完成。包含源码级流程分析。"
-keywords: ["Agentic Loop", "AI 循环", "工具调用", "自主决策", "ReAct 模式"]
+description: "深入解析 Claude Code 的 query() 异步生成器循环——从流式 API 调用、工具并行执行、上下文压缩、错误恢复到终止条件的完整状态机，基于 src/query.ts 的源码级分析。"
+keywords: ["Agentic Loop", "query loop", "tool_use", "状态机", "auto-compact", "streaming", "recovery"]
 ---
 
-{/* 本章目标：解释 Agentic Loop 这个核心机制 */}
+{/* 本章目标：基于 src/query.ts 揭示 Agentic Loop 的完整状态机 */}
 
 ## 什么是 Agentic Loop
 
 传统聊天机器人：你问一句，它答一句。  
 Claude Code 不一样：你说一个需求，它可能连续执行十几步操作才给你最终结果。
 
-这背后的机制叫做 **Agentic Loop**（智能体循环）：
+这背后的机制叫做 **Agentic Loop**（智能体循环），核心实现在 `src/query.ts` 的 `queryLoop()` 异步生成器函数（第 241 行）。它是一个 `while(true)` 无限循环，每次迭代代表一次"思考→行动→观察"周期。
 
 <Frame caption="Agentic Loop 循环示意">
   <img src="/docs/images/agentic-loop.png" alt="Agentic Loop 循环图" />
 </Frame>
 
-<Steps>
-  <Step title="思考">
-    AI 分析当前上下文，决定下一步该做什么
-  </Step>
-  <Step title="行动">
-    AI 发出工具调用请求（比如"读取这个文件"、"执行这条命令"）
-  </Step>
-  <Step title="观察">
-    工具执行完毕，结果回传给 AI
-  </Step>
-  <Step title="循环或结束">
-    AI 根据观察结果决定：继续下一步操作，还是任务已完成、直接回答用户
-  </Step>
-</Steps>
-
-## 一个真实的例子
+## 循环的完整结构
 
-> 用户："帮我找到项目里所有未使用的导入语句，然后删掉它们"
+`queryLoop()` 的每次迭代（`src/query.ts:307` `while(true)`）包含以下阶段：
+
+### 阶段 1：上下文预处理（Pre-Processing Pipeline）
+
+在调用 API 之前，依次执行 5 个压缩/优化步骤：
+
+```
+messagesForQuery（原始消息）
+  ↓ applyToolResultBudget()    — 工具结果预算截断（按 maxResultSizeChars）
+  ↓ snipCompactIfNeeded()      — 历史 Snip 压缩（HISTORY_SNIP feature）
+  ↓ microcompact()             — 微压缩（工具结果摘要）
+  ↓ applyCollapsesIfNeeded()   — 上下文折叠（CONTEXT_COLLAPSE feature）
+  ↓ autocompact()              — 自动压缩（超出阈值时触发）
+messagesForQuery（处理后的消息）→ 发往 API
+```
+
+每个步骤的输出是下一步的输入，形成串行管道。Snip 和 Microcompact 的释放 token 数会传递给 autocompact 的阈值计算（`snipTokensFreed`），避免重复压缩。
+
+### 阶段 2：流式 API 调用（Streaming Loop）
+
+`deps.callModel()` 发起流式请求（第 659 行），返回一个 AsyncGenerator。在流式过程中：
+
+- **AssistantMessage** 被收集到 `assistantMessages[]` 数组
+- **tool_use 块** 被提取到 `toolUseBlocks[]`，设置 `needsFollowUp = true`
+- **StreamingToolExecutor** 在流式过程中就开始并行执行工具（不等流结束）
+- 可恢复的错误（prompt-too-long、max-output-tokens）被**暂扣**（withheld），先尝试恢复
+
+流式回调中的关键守卫：
+- `backfillObservableInput()`（第 763 行）—— 为 tool_use 块回填可观察字段（如文件路径展开），但只在添加了新字段时才克隆消息，避免破坏 prompt cache 的字节一致性
+- 流式降级检测——如果 `streamingFallbackOccured`，已收集的消息被标记为 tombstone（第 717 行），清空后重试
+
+### 阶段 3：工具执行（Tool Execution）
+
+如果 `needsFollowUp` 为 true，循环不会终止，而是执行工具：
+
+```typescript
+// 两种工具执行器（互斥）
+const toolUpdates = streamingToolExecutor
+  ? streamingToolExecutor.getRemainingResults()  // 流式：获取已完成的+等待中的
+  : runTools(toolUseBlocks, assistantMessages, canUseTool, toolUseContext)
+```
+
+工具结果通过 `normalizeMessagesForAPI()` 标准化后，与原始消息合并，进入**下一轮循环迭代**。
+
+### 阶段 4：终止或继续
+
+每次迭代结束时，根据条件决定 `return`（终止）或 `continue`（继续）：
+
+## 7 种终止条件（源码级）
 
-AI 的内部过程：
+| 终止原因 | 触发位置 | 机制 |
+|----------|---------|------|
+| **completed** | 第 1360 行 | AI 未发出 tool_use → `needsFollowUp = false` → 经过 stop hooks → 返回 |
+| **blocking_limit** | 第 646 行 | Token 计数超过硬限制（非 autocompact 模式）→ 生成 PTL 错误消息 → 返回 |
+| **aborted_streaming** | 第 1054 行 | `abortController.signal.aborted` → 为未完成的 tool_use 生成合成 tool_result → 返回 |
+| **model_error** | 第 999 行 | `callModel()` 抛出异常 → 生成错误消息 → 返回 |
+| **prompt_too_long** | 第 1178 行 | 413 错误且 reactive compact 无法恢复 → 暂扣的错误消息被释放 → 返回 |
+| **image_error** | 第 980/1178 行 | 图片尺寸/大小错误 → 直接返回 |
+| **stop_hook_prevented** | 第 1282 行 | Stop hook 返回 `preventContinuation: true` → 返回 |
 
-1. **思考**：我需要先了解项目结构 → **行动**：调用 Glob 工具扫描所有源文件
-2. **观察**：拿到文件列表 → **思考**：逐个检查 → **行动**：调用 Grep 搜索 import 语句
-3. **观察**：发现 3 个文件有未使用导入 → **行动**：调用 FileEdit 逐个删除
-4. **观察**：编辑成功 → **结束**：告诉用户"已清理 3 个文件中的 5 条未使用导入"
+## 4 种继续条件（恢复路径）
 
-整个过程可能涉及 10+ 次工具调用，但用户只需要说一句话。
+循环不仅是一个简单的"有 tool_use 就继续"，它还包含多种恢复/重试路径：
+
+### 1. 正常工具循环
+`needsFollowUp = true` → 执行工具 → 新消息追加到 `messagesForQuery` → `continue`
+
+### 2. max_output_tokens 恢复（第 1191-1255 行）
+当 AI 输出被截断时（`apiError === 'max_output_tokens'`）：
+- **首次**：尝试将 `maxOutputTokens` 从默认值提升到 `ESCALATED_MAX_TOKENS`（64K），无 meta 消息，静默重试
+- **后续**：注入恢复消息"Output token limit hit. Resume directly..."，最多重试 `MAX_OUTPUT_TOKENS_RECOVERY_LIMIT = 3` 次
+- 恢复耗尽后，暂扣的错误消息被释放
+
+### 3. Prompt-Too-Long 恢复（第 1088-1186 行）
+当遇到 413 错误时，有两个恢复阶段：
+- **Context Collapse Drain**（第 1097 行）：提交所有已暂存的折叠，释放空间后重试。如果上一轮已经是 collapse_drain_retry 则跳过
+- **Reactive Compact**（第 1123 行）：触发即时压缩，生成摘要后重试。`hasAttemptedReactiveCompact` 防止无限循环
+
+### 4. Stop Hook 阻塞重试（第 1285-1308 行）
+Stop hook 可以注入阻塞错误消息，强制 AI 重新思考。新的消息（包含阻塞错误）被追加到对话中，`stopHookActive = true`，进入下一轮迭代。
+
+## 模型降级（Fallback）
+
+当主模型不可用时（`FallbackTriggeredError`，第 897 行）：
+
+1. 已收集的 `assistantMessages` 被清空，tool_use 块收到合成 tool_result："Model fallback triggered"
+2. 思维签名块被移除（`stripSignatureBlocks`）—— 因为思维签名与模型绑定，跨模型回放会 400
+3. 切换到 `fallbackModel`，更新 `toolUseContext.options.mainLoopModel`
+4. 生成系统消息："Switched to {fallback} due to high demand for {original}"
+5. 重新发起流式请求
+
+## 状态机：State 对象
+
+每次迭代的状态通过 `State` 类型（第 204 行）传递：
+
+```typescript
+type State = {
+  messages: Message[]                        // 当前对话消息
+  toolUseContext: ToolUseContext              // 工具上下文（含权限）
+  autoCompactTracking: AutoCompactTrackingState  // 压缩跟踪
+  maxOutputTokensRecoveryCount: number       // 输出截断恢复计数
+  hasAttemptedReactiveCompact: boolean       // 是否已尝试即时压缩
+  maxOutputTokensOverride: number | undefined // 输出 token 上限覆盖
+  pendingToolUseSummary: Promise<...> | undefined  // 异步工具摘要
+  stopHookActive: boolean | undefined        // Stop hook 是否激活
+  turnCount: number                          // 轮次计数
+  transition: Continue | undefined           // 上一次继续的原因
+}
+```
+
+每次 `continue` 都创建新的 State 对象（不可变更新），而非就地修改。`transition` 字段记录了为什么继续——让后续迭代能检测特定恢复路径（如 `collapse_drain_retry`）避免循环。
+
+## Token Budget（实验性）
+
+当 `TOKEN_BUDGET` feature 启用时（第 1311 行），循环在终止前会检查 token 消耗：
+
+- **continuation**：未达到预算但超过阈值 → 注入 nudge 消息，让 AI 加速收尾
+- **diminishing_returns**：检测到收益递减 → 提前终止
+- 预算数据来自 `createBudgetTracker()`，跨迭代累计
 
 ## 为什么不是"一次规划，批量执行"
 
 <Note>
-一个常见的替代方案是：AI 先生成一个完整的计划，然后一次性执行所有步骤。Claude Code 选择了逐步循环，原因是：
+源码揭示了为什么 Claude Code 选择逐步循环：
 </Note>
 
-- **每一步都能看到真实结果**：文件内容、命令输出、错误信息——这些只有执行后才知道
-- **动态调整**：如果第 3 步发现了意外情况，AI 可以立刻改变策略
-- **错误恢复**：某步失败了，AI 可以当场诊断和修复，不需要推倒重来
-- **用户可控**：用户可以在任何一步中断，AI 的循环不会失控
+- **每一步都产生真实信息**：`runTools()` 返回的 `toolResults` 是 API 不可能预知的——命令输出、文件内容、错误信息
+- **动态上下文管理**：每轮迭代前都重新评估压缩需求（autocompact → microcompact → snip），基于最新的 token 计数
+- **错误即时恢复**：工具失败不需要推倒重来——stop hook 可以注入阻塞错误让 AI 修正策略
+- **用户可控**：`abortController.signal` 在循环的多个检查点被检测（第 1018、1048、1488 行），用户按 ESC 可以优雅中断
+- **成本控制**：Token Budget 在每轮终止前检查，防止 AI 无效循环
 
-## 循环的终止条件
+## 一个完整的迭代示例
 
-Agentic Loop 不会无限运行，以下情况会让循环停止：
+> 用户："帮我找到项目里所有未使用的导入语句，然后删掉它们"
 
-| 条件 | 说明 |
-|------|------|
-| AI 主动结束 | AI 判断任务完成，返回纯文本回答（不再调用工具） |
-| 用户中断 | 用户按 Ctrl+C 或 ESC 打断当前操作 |
-| Token 预算耗尽 | 单轮对话的 token 用量达到上限 |
-| 输出过长自动续写 | AI 回复被截断时，系统自动发起续写请求（有次数上限） |
-| 成本上限 | 累计 API 花费超过用户设定的预算 |
+```
+迭代 1: 思考→行动
+  预处理: 无需压缩（上下文很短）
+  API 调用: 返回 tool_use(Glob, "**/*.ts")
+  工具执行: 返回 42 个文件路径
+  → needsFollowUp = true, continue
+
+迭代 2: 思考→行动
+  预处理: 42 个文件结果仍在预算内
+  API 调用: 返回 tool_use(Grep, "import.*from")
+  工具执行: 在 15 个文件中找到 120 条 import
+  → needsFollowUp = true, continue
+
+迭代 3: 思考→行动（多轮）
+  预处理: 120 条 Grep 结果触发 microcompact → 摘要化
+  API 调用: 返回 3 个 tool_use(FileEdit, ...)
+  工具执行: 删除 5 条未使用导入
+  → needsFollowUp = true, continue
+
+迭代 4: 总结
+  API 调用: 返回纯文本"已清理 3 个文件中的 5 条未使用导入"
+  → needsFollowUp = false
+  → Stop hooks 通过
+  → return { reason: 'completed' }
+```

docs/extensibility/skills.mdx

@@ -1,61 +1,221 @@
 ---
-title: "Skills 技能系统 - 可复用的 AI 工作流封装"
-description: "详解 Claude Code Skills 系统：如何将常用工作流封装为可复用的技能包，Skills 与 Tools 的区别，以及技能定义和加载机制。"
-keywords: ["Skills", "技能系统", "工作流封装", "可复用技能", "AI 工作流"]
+title: "Skills 技能系统 - Prompt 即能力的架构哲学"
+description: "深入剖析 Claude Code Skills 系统的完整实现：从磁盘加载、Frontmatter 解析、预算感知描述截断、双模式执行（inline/fork）、权限白名单、条件激活、动态发现到远程技能加载，揭示一条完整的 Skill 生命周期链路。"
+keywords: ["Skills", "SkillTool", "技能加载", "Frontmatter", "whenToUse", "allowedTools", "fork执行", "动态发现"]
 ---
 
-{/* 本章目标：解释 Skills 系统的设计思想 */}
+{/* 本章目标：揭示 Skill 系统从文件到执行的全链路实现 */}
 
-## Tool vs Skill
+## Tool vs Skill：本质差异
 
 | | Tool | Skill |
 |---|---|---|
 | 粒度 | 单个原子操作（读文件、执行命令） | 一套完整的工作流（代码审查、创建 PR） |
-| 触发方式 | AI 自主选择 | 用户主动调用（`/skill-name`）或 AI 根据场景推荐 |
-| 本质 | 执行逻辑 | 预制的 Prompt + 工具权限配置 |
+| 触发方式 | AI 自主选择 | 用户 `/skill-name` 或 AI 通过 `SkillTool` 自动匹配 |
+| 本质 | TypeScript 执行逻辑 | **Prompt + 权限配置**的声明式封装 |
+| 注册位置 | `src/tools.ts` → `getTools()` | `src/commands.ts` → `getCommands()` |
+| 执行器 | 各 Tool 的 `call()` 方法 | `SkillTool.call()` → 两条分支（inline / fork） |
 
-## Skill 的三个来源
+Skill 的核心洞见：**复杂任务的关键不在代码逻辑，而在 Prompt 质量**。一个代码审查 Skill 不需要审查引擎，只需告诉 AI "审查什么、按什么顺序、输出什么格式"——Skill 把这种"经验"封装为可复用的 Markdown。
 
-<CardGroup cols={3}>
-  <Card title="内置 Skill" icon="box">
-    编译进 CLI 的技能包。如 `/commit`、`/review`、`/debug`
-  </Card>
-  <Card title="项目 Skill" icon="folder-open">
-    项目 `.claude/skills/` 目录中的 Markdown 文件。团队共享
-  </Card>
-  <Card title="MCP Skill" icon="plug">
-    通过 MCP Server 提供的技能。动态发现
-  </Card>
-</CardGroup>
+## Skill 的五个来源与加载链路
 
-## 一个 Skill 包含什么
+### 1. 内置命令（Built-in Commands）
 
-每个 Skill 本质上是一个"AI 行为的预设"：
+硬编码在 `src/commands.ts:258` 的 `COMMANDS` memoize 数组中，包含 70+ 条命令（`/commit`、`/review`、`/compact` 等）。这些是 TypeScript 模块而非 Markdown，但实现了相同的 `Command` 接口（`src/types/command.ts`）。
 
-| 组成部分 | 作用 |
-|----------|------|
-| **名称和描述** | 告诉 AI 和用户这个技能做什么 |
-| **whenToUse** | 什么场景下应该使用这个技能（AI 据此自动推荐） |
-| **Prompt 模板** | 注入给 AI 的详细指令——相当于"操作手册" |
-| **allowedTools** | 这个技能允许使用哪些工具（能力边界） |
-| **model** | 可选指定使用的模型 |
+### 2. Bundled Skills（编译时打包）
 
-## 设计精妙之处
+通过 `registerBundledSkill()`（`src/skills/bundledSkills.ts:53`）在模块初始化时注册。关键特性：
 
-Skill 的核心洞见是：**很多复杂任务的关键不在于代码逻辑，而在于 Prompt 的质量**。
+- **延迟文件提取**：如果 Skill 声明了 `files`（参考文件），首次调用时才解压到临时目录（`getBundledSkillExtractDir()`），使用 `O_NOFOLLOW | O_EXCL` 防止符号链接攻击（`safeWriteFile`，第 186 行）
+- **闭包级 memoize**：并发调用共享同一个 extraction promise，避免竞态写入
+- 来源标记为 `source: 'bundled'`，在 Prompt 预算中享有**不可截断**的特权
 
-一个好的代码审查，不是写了什么代码来审查，而是：
-- 告诉 AI 审查的标准是什么
-- 告诉 AI 按什么顺序审查
-- 告诉 AI 输出什么格式的报告
-- 限制 AI 只能用读取类工具（不要边审查边改代码）
+### 3. 磁盘 Skills（`.claude/skills/`）
 
-Skill 把这些"经验"封装起来，任何人都能一键调用。
+由 `loadSkillsFromSkillsDir()`（`src/skills/loadSkillsDir.ts:407`）加载，这是最重要的加载路径：
 
-## 技能发现
+```
+管理策略: $MANAGED_DIR/.claude/skills/     (policySettings)
+用户全局: ~/.claude/skills/                 (userSettings)
+项目级:   .claude/skills/                   (projectSettings, 向上遍历至 home)
+附加目录: --add-dir 指定的路径下 .claude/skills/
+```
 
-当可用技能很多时，AI 可以通过 **SkillTool** 搜索匹配的技能：
+**加载协议**：只识别 `skill-name/SKILL.md` 目录格式，不再支持单文件 `.md`。加载流程：
 
-- 用户说"帮我做代码审查"
-- AI 搜索已注册的技能，发现 `code-review` 匹配
-- AI 调用该技能，按预设的流程执行
+1. `readdir` 扫描目录 → 仅保留 `isDirectory()` 或 `isSymbolicLink()` 的条目
+2. 在每个子目录中查找 `SKILL.md`，未找到则跳过
+3. `parseFrontmatter()` 解析 YAML 头部，提取 `whenToUse`、`allowedTools`、`context` 等字段
+4. `parseSkillFrontmatterFields()`（第 185 行）统一解析 17 个 frontmatter 字段
+5. `createSkillCommand()`（第 270 行）构造 `Command` 对象
+
+**去重机制**：使用 `realpath()` 解析符号链接获得规范路径（`getFileIdentity`，第 118 行），避免通过符号链接或重叠父目录导致的重复加载。
+
+### 4. MCP Skills（动态发现）
+
+通过 `registerMCPSkillBuilders()` 注册构建器，MCP Server 的 prompt 被 `mcpSkillBuilders.ts` 转换为 `Command` 对象。标记为 `loadedFrom: 'mcp'`。
+
+**安全边界**：MCP Skills 的 Prompt 内容**禁止执行内联 shell 命令**（`loadSkillsDir.ts:374` 的 `loadedFrom !== 'mcp'` 守卫），因为远程内容不可信。
+
+### 5. Legacy Commands（`/commands/` 目录）
+
+向后兼容的旧格式，由 `loadSkillsFromCommandsDir()`（第 566 行）加载。同时支持 `SKILL.md` 目录格式和单 `.md` 文件格式。
+
+## Frontmatter 字段全景
+
+一个 `SKILL.md` 的完整 frontmatter（`parseSkillFrontmatterFields`，第 185 行）：
+
+```yaml
+---
+name: code-review                    # 显示名称（覆盖目录名）
+description: 系统性代码审查           # 描述（或从 Markdown 首段提取）
+when_to_use: "用户说审查代码、找 bug"  # AI 自动匹配依据
+allowed-tools:                       # 工具白名单
+  - Read
+  - Grep
+  - Glob
+argument-hint: "<file-or-directory>" # 参数提示
+arguments: [path]                    # 声明式参数名（用于 $ARGUMENTS 替换）
+model: opus                          # 模型覆盖
+effort: high                         # 努力级别
+context: fork                        # 执行模式：inline（默认）| fork
+agent: code-reviewer                 # 指定 Agent 定义文件
+user-invocable: true                 # 用户是否可 /调用
+disable-model-invocation: false      # 禁止 AI 自主调用
+version: "1.0"                       # 版本号
+paths:                               # 条件激活的文件路径模式
+  - "src/**/*.ts"
+hooks:                               # Hook 配置
+  PreToolUse:
+    - command: ["echo", "checking"]
+shell: ["bash"]                      # Shell 执行环境
+---
+```
+
+解析后有 17 个字段被提取，其中 `allowedTools`、`model`、`effort` 在执行时动态修改 `toolPermissionContext`。
+
+## 两条执行路径：Inline vs Fork
+
+SkillTool（`src/tools/SkillTool/SkillTool.ts:332`）在 `call()` 中根据 `command.context` 分流：
+
+### Inline 模式（默认）
+
+Skill 的 Prompt 内容被注入为 **UserMessage**，在主对话流中继续执行：
+
+1. `processPromptSlashCommand()` 处理参数替换（`$ARGUMENTS`）和 shell 命令展开（`` !`...` ``）
+2. `${CLAUDE_SKILL_DIR}` 被替换为 Skill 所在目录的绝对路径
+3. `${CLAUDE_SESSION_ID}` 被替换为当前会话 ID
+4. 返回 `newMessages`（注入到对话流）+ `contextModifier`（修改权限上下文）
+
+`contextModifier`（第 776 行）做了三件事：
+- **工具白名单注入**：将 `allowedTools` 合并到 `alwaysAllowRules.command`
+- **模型切换**：`resolveSkillModelOverride()` 处理模型覆盖，保留 `[1m]` 后缀以避免 200K 窗口截断
+- **努力级别覆盖**：修改 `effortValue`
+
+### Fork 模式（`context: fork`）
+
+Skill 在**独立子 Agent** 中执行（`executeForkedSkill`，第 122 行）：
+
+1. `prepareForkedCommandContext()` 构建隔离的 Agent 定义和 Prompt
+2. `runAgent()` 启动子 Agent 循环，拥有独立的 token 预算
+3. 通过 `onProgress` 回调报告工具使用进度
+4. 结果通过 `extractResultText()` 提取，子 Agent 的全部消息在提取后被释放（`agentMessages.length = 0`）
+5. 最终通过 `clearInvokedSkillsForAgent()` 清理状态
+
+Fork 模式适用于需要强隔离的场景（如长时间运行的审查任务），避免污染主对话的上下文。
+
+## 权限模型：Safe Properties 白名单
+
+`checkPermissions()`（第 433 行）实现了一个四层权限检查：
+
+```
+1. Deny 规则匹配（支持精确匹配和 prefix:* 通配符）
+   ↓ 未命中
+2. 官方市场 Skill 自动放行（plugin + isOfficialMarketplaceName）
+   ↓ 未命中
+3. Allow 规则匹配
+   ↓ 未命中
+4. Safe Properties 白名单检查（skillHasOnlySafeProperties，第 911 行）
+   ↓ 有非安全属性
+5. Ask 用户确认（附带精确匹配和前缀匹配两条建议规则）
+```
+
+**Safe Properties**（`SAFE_SKILL_PROPERTIES`，第 876 行）是一个包含 28 个属性名的白名单。任何不在白名单中的**有意义的属性值**（排除 `undefined`、`null`、空数组、空对象）都会触发权限请求。这是**正向安全**设计——未来新增的属性默认需要权限。
+
+## Prompt 预算：1% 上下文窗口的截断策略
+
+Skill 列表注入 System Prompt 时有严格的字符预算（`prompt.ts`）：
+
+- **预算计算**：`contextWindowTokens × 4 chars/token × 1%`（约 8000 字符）
+- **单条上限**：`MAX_LISTING_DESC_CHARS = 250` 字符（超出截断为 `…`）
+- **Bundled Skills 不可截断**：它们始终保留完整描述，预算不足时只截断非 bundled 的
+- **降级策略**：
+  1. 尝试完整描述 → 超预算？
+  2. Bundled 保留完整，非 bundled 均分剩余预算 → 每条描述低于 20 字符？
+  3. 非 bundled 仅保留名称
+
+`formatCommandsWithinBudget()`（`prompt.ts:70`）实现了这个三级降级。
+
+## 动态发现与条件激活
+
+### 基于文件路径的动态发现
+
+`discoverSkillDirsForPaths()`（`loadSkillsDir.ts:861`）在文件操作时触发：
+
+1. 从被操作的文件路径开始，**向上遍历**至 CWD（不包含 CWD 本身）
+2. 在每层查找 `.claude/skills/` 目录
+3. 使用 `realpath` 去重，`git check-ignore` 过滤 gitignored 目录
+4. 按路径深度排序（**深层优先**），更接近文件的 Skill 优先级更高
+
+### 条件激活（paths frontmatter）
+
+带有 `paths` 模式的 Skill 在加载时不会立即可用，而是存入 `conditionalSkills` Map。当被操作的文件路径匹配某个 Skill 的 paths 模式时（使用 `ignore` 库做 gitignore 风格匹配），该 Skill 才被**激活**——从 `conditionalSkills` 移入 `dynamicSkills`。
+
+这意味着一个只在 `*.test.ts` 上激活的测试 Skill，平时完全不可见，只有当 AI 读取或编辑测试文件时才会出现。
+
+## 使用频率排名
+
+`recordSkillUsage()`（`skillUsageTracking.ts`）使用指数衰减算法计算 Skill 排名分数：
+
+```
+score = usageCount × max(0.5^(daysSinceUse / 7), 0.1)
+```
+
+- **7 天半衰期**：一周前的使用权重减半
+- **最低 0.1 保底**：避免老但高频使用的 Skill 完全沉底
+- **60 秒去抖**：同一 Skill 在 1 分钟内的多次调用只计一次，减少文件 I/O
+
+排名数据持久化在全局配置的 `skillUsage` 字段中。
+
+## 远程技能加载（Experimental）
+
+通过 `EXPERIMENTAL_SKILL_SEARCH` feature flag 控制，支持从远程（AKI/GCS/S3）加载 `_canonical_<slug>` 格式的 Skill：
+
+1. `validateInput()` 中 `stripCanonicalPrefix()` 拦截 canonical 名称
+2. `executeRemoteSkill()`（第 970 行）从远程 URL 加载 SKILL.md
+3. 支持 `gs://`、`https://`、`s3://` 等 URL 协议
+4. 内容经过 frontmatter 剥离、`${CLAUDE_SKILL_DIR}` 替换后直接注入
+5. 通过 `addInvokedSkill()` 注册到 compaction 保留状态，确保压缩后仍可恢复
+6. 远程 Skill 不经过 `processPromptSlashCommand`——无 `!command` 替换、无 `$ARGUMENTS` 展开
+
+## 完整生命周期总结
+
+```
+磁盘 SKILL.md
+  ↓ parseFrontmatter()
+  ↓ parseSkillFrontmatterFields() → 17 个字段
+  ↓ createSkillCommand() → Command 对象
+  ↓ 去重（realpath + seenFileIds）
+  ↓ 条件 Skill → conditionalSkills Map（等待路径匹配激活）
+  ↓ getSkillDirCommands() memoize 缓存
+  ↓ getAllCommands() 合并 local + MCP
+  ↓ formatCommandsWithinBudget() → 截断后的 Skill 列表注入 System Prompt
+  ↓ AI 选择匹配的 Skill
+  ↓ SkillTool.validateInput() → 名称校验 + 存在性检查
+  ↓ SkillTool.checkPermissions() → 四层权限检查
+  ↓ SkillTool.call() → inline 或 fork 执行
+  ↓ contextModifier() → 注入 allowedTools + model + effort
+  ↓ recordSkillUsage() → 更新使用频率排名
+```

docs/introduction/architecture-overview.mdx

@@ -1,7 +1,7 @@
 ---
 title: "架构全景 - Claude Code 五层架构详解"
-description: "从交互层到基础设施层，详解 Claude Code 的五层架构设计。涵盖 React/Ink UI、QueryEngine 编排、Agentic Loop 核心循环、Tool 系统和 API 层。"
-keywords: ["Claude Code 架构", "五层架构", "QueryEngine", "Agentic Loop", "系统设计"]
+description: "从交互层到基础设施层，详解 Claude Code 的五层架构设计。基于 src/main.tsx、src/QueryEngine.ts、src/query.ts、src/tools.ts、src/services/api/claude.ts 的源码级数据流分析。"
+keywords: ["Claude Code 架构", "五层架构", "QueryEngine", "Agentic Loop", "数据流"]
 ---
 
 {/* 本章目标：一张图讲清楚整体架构，为后续章节建立坐标系 */}
@@ -14,53 +14,99 @@ Claude Code 从上到下分为五个层次，每一层职责清晰、边界分
   <img src="/docs/images/architecture-layers.png" alt="Claude Code 五层架构图" />
 </Frame>
 
-| 层次 | 职责 | 关键词 |
-|------|------|--------|
-| **交互层** | 终端 UI、用户输入、消息展示 | React/Ink、REPL |
-| **编排层** | 管理多轮对话、会话生命周期、成本追踪 | QueryEngine、会话持久化 |
-| **核心循环层** | 单轮对话：发请求 → 拿响应 → 执行工具 → 再发请求 | Agentic Loop |
-| **工具层** | AI 的"双手"——读写文件、执行命令、搜索代码 | Tool System、MCP |
-| **通信层** | 与 Claude API 的流式通信、多云 Provider 适配 | Streaming、Bedrock/Vertex |
+| 层次 | 职责 | 入口源码 | 关键词 |
+|------|------|---------|--------|
+| **交互层** | 终端 UI、用户输入、消息展示 | `src/screens/REPL.tsx` | React/Ink、PromptInput |
+| **编排层** | 多轮对话、会话持久化、成本追踪 | `src/QueryEngine.ts` | QueryEngine、transcript |
+| **核心循环层** | 单轮：发请求 → 拿响应 → 执行工具 → 循环 | `src/query.ts` | Agentic Loop、State |
+| **工具层** | AI 的"双手"——读写文件、执行命令 | `src/tools.ts` → `src/Tool.ts` | Tool 接口、MCP |
+| **通信层** | 与 Claude API 的流式通信 | `src/services/api/claude.ts` | Streaming、Provider |
 
-## 一条主数据流
+## 一条主数据流的源码追踪
 
 <Frame caption="核心数据流">
   <img src="/docs/images/data-flow.png" alt="Claude Code 核心数据流" />
 </Frame>
 
-整个系统的运转可以浓缩为一条核心数据流：
-
-<Steps>
-  <Step title="用户输入">
-    用户在终端键入自然语言需求
-  </Step>
-  <Step title="上下文组装">
-    系统自动拼接项目信息、git 状态、配置文件、记忆，形成完整的 System Prompt
-  </Step>
-  <Step title="API 调用">
-    将 System Prompt + 对话历史发送给 Claude API，流式接收响应
-  </Step>
-  <Step title="工具调用循环">
-    若 AI 返回工具调用请求 → 权限检查 → 执行工具 → 结果回传 → AI 继续思考 → 循环
-  </Step>
-  <Step title="任务完成">
-    AI 不再调用工具，输出最终回答，等待用户下一条输入
-  </Step>
-</Steps>
+整个系统的运转可以浓缩为一条核心数据流，以下是每一步对应的源码路径：
+
+### 1. 用户输入 → REPL
+
+`src/screens/REPL.tsx` 是基于 React/Ink 的终端 UI 组件。用户输入经 `processUserInput()`（`src/utils/processUserInput/processUserInput.ts`）处理，支持斜杠命令、文件附件、图片等。
+
+### 2. QueryEngine 编排
+
+`src/QueryEngine.ts` 是 REPL 与 `query()` 之间的中间层，管理：
+- **会话状态**：消息数组、工具权限上下文（`ToolPermissionContext`）、文件历史快照
+- **成本追踪**：`accumulateUsage()` / `getTotalCost()` 累计 token 用量
+- **Transcript 持久化**：`recordTranscript()` 将对话序列化到磁盘，支持 `--resume`
+- **文件历史**：`fileHistoryMakeSnapshot()` 在修改前创建快照，支持 undo
+
+关键方法：`queryEngine.query()` 构造 `QueryParams`，调用 `query()` 异步生成器。
+
+### 3. Agentic Loop（`src/query.ts`）
+
+`query()` 是一个 `AsyncGenerator`，`while(true)` 循环的每次迭代包含：
+
+```
+① 上下文预处理管道：
+   applyToolResultBudget → snipCompact → microcompact → contextCollapse → autocompact
+
+② 流式 API 调用：
+   deps.callModel() → AsyncGenerator<StreamEvent | Message>
+   收集 assistantMessages[]、toolUseBlocks[]
+
+③ 工具执行：
+   StreamingToolExecutor（并行） 或 runTools（串行）
+   → toolResults[]
+
+④ 终止/继续判定：
+   needsFollowUp ? continue : return { reason }
+```
+
+完整的状态机通过 `State` 类型（`src/query.ts:204`）在迭代间传递，包含 10 个字段（messages、autoCompactTracking、maxOutputTokensRecoveryCount 等）。
+
+### 4. 工具层（`src/tools.ts` → `src/Tool.ts`）
+
+`getAllBaseTools()`（`src/tools.ts:191`）组装 50+ 工具列表，经过 `filterToolsByDenyRules()` 权限过滤后传给 API。
+
+每个工具实现 `Tool<Input, Output, Progress>` 接口（`src/Tool.ts:362`），核心方法链：
+```
+validateInput() → canUseTool()（UI 层）→ checkPermissions() → call() → ToolResult
+```
+
+### 5. 通信层（`src/services/api/claude.ts`）
+
+API 客户端支持 4 种 Provider：
+- **Anthropic Direct**：默认
+- **AWS Bedrock**：`ANTHROPIC_BEDROCK_BASE_URL`
+- **Google Vertex**：`ANTHROPIC_VERTEX_PROJECT_ID`
+- **Azure**：通过自定义 base URL
+
+`deps.callModel()` 发起流式请求，返回 `BetaRawMessageStreamEvent` 事件流。支持 Prompt Cache（`cache_control`）、thinking blocks、multi-turn tool use。
 
 ## 四个核心设计原则
 
 <AccordionGroup>
   <Accordion title="流式优先 (Streaming-first)">
-    所有 API 通信都是流式的——用户看到 AI "逐字打出"回答，而不是等待完整响应。工具执行结果也实时反馈。这不仅提升体验，更是处理长时间任务的工程必需。
+    所有 API 通信都是流式的——`deps.callModel()` 返回 AsyncGenerator，用户看到 AI "逐字打出"回答。StreamingToolExecutor 在流式过程中就开始并行执行工具，不等流结束。模型降级（Fallback）时，已收集的 assistantMessages 被标记为 tombstone 并清空，重试整个流式请求。
   </Accordion>
   <Accordion title="工具即能力 (Tool as Capability)">
-    AI 的每一项"动手能力"都被抽象为一个 Tool。想让 AI 能做新事情？注册一个新 Tool 就好。统一的接口让能力可插拔、可组合。
+    每个工具是 `Tool<Input, Output, Progress>` 结构化类型，通过 `buildTool()` 工厂创建。`getTools()` 在每次 API 调用时组装（非全局缓存），因为 `isEnabled()` 可能随运行时状态变化。MCP 工具通过 `mcpInfo` 字段标记来源，支持 server 级别的 blanket deny。
   </Accordion>
   <Accordion title="权限即边界 (Permission as Boundary)">
-    AI 能操作真实环境是强大的，也是危险的。每个工具调用都经过权限系统的裁决——该放行的自动放行，该拦截的坚决拦截。
+    每次工具调用经过 `validateInput() → checkPermissions()` 双重检查。权限规则从 5 个来源汇聚（session → project → user → managed → default），支持工具名、命令模式、路径前缀等匹配方式。Plan Mode 通过 `prepareContextForPlanMode()` 切换为只读模式，退出时自动恢复。
   </Accordion>
   <Accordion title="上下文即记忆 (Context as Memory)">
-    AI 没有真正的记忆，但通过精心的 System Prompt 组装、对话压缩、持久化记忆文件，系统营造出"AI 理解你的项目"的效果。这是上下文工程的核心。
+    System Prompt 由 `fetchSystemPromptParts()` 动态组装，包含 CLAUDE.md、git 状态、日期、MCP 服务器列表。Auto-compact 在每轮迭代前评估 token 阈值，超出时触发压缩。压缩后的摘要通过 `buildPostCompactMessages()` 替换原始消息，`taskBudgetRemaining` 跨压缩边界累计。
   </Accordion>
 </AccordionGroup>
+
+## 入口与引导
+
+| 入口 | 文件 | 说明 |
+|------|------|------|
+| CLI 启动 | `src/entrypoints/cli.tsx` | 注入 `feature()` polyfill（始终返回 false）、MACRO 全局变量 |
+| 命令定义 | `src/main.tsx` | Commander.js 解析参数，初始化 auth/analytics/policy |
+| 一次性初始化 | `src/entrypoints/init.ts` | 遥测配置、信任对话框 |
+| 管道模式 | `src/main.tsx` `-p` flag | `echo "say hello" \| bun run dev -p` |

docs/safety/permission-model.mdx

@@ -1,69 +1,170 @@
 ---
 title: "权限模型 - Allow/Ask/Deny 三级权限体系"
-description: "详解 Claude Code 的三级权限模型：Allow 自动放行、Ask 确认对话框、Deny 直接拒绝。权限规则的层级来源与优先级机制。"
-keywords: ["权限模型", "Allow Ask Deny", "权限控制", "安全权限", "工具权限"]
+description: "详解 Claude Code 的三级权限模型实现：基于 src/utils/permissions/permissions.ts 的规则匹配引擎、五层规则来源优先级、工具名/命令/路径三维度匹配、Denial Tracking 死循环防护、权限模式切换机制。"
+keywords: ["权限模型", "Allow Ask Deny", "PermissionRule", "checkPermissions", "Denial Tracking", "权限规则"]
 ---
 
-{/* 本章目标：详解权限系统的设计 */}
+{/* 本章目标：基于源码揭示权限系统的完整实现 */}
 
 ## 三种权限行为
 
 每一次工具调用，系统都会做出三种裁决之一：
 
-| 行为 | 含义 | 典型场景 |
-|------|------|---------|
-| **Allow** | 自动放行，用户无感知 | Read 工具读取项目内的文件 |
-| **Ask** | 弹出确认对话框，等待用户决定 | Bash 执行一条未知命令 |
-| **Deny** | 直接拒绝，AI 收到"权限被拒"的反馈 | 尝试执行被禁止的命令 |
-
-## 权限规则的层级
-
-规则可以来自多个来源，优先级从高到低：
-
-<Frame caption="权限规则层级（优先级从上到下递减）">
-  <img src="/docs/images/permission-layers.png" alt="权限层级图" />
-</Frame>
-
-<Steps>
-  <Step title="用户会话内设置">
-    用户在当前对话中手动授权的（"对这个工具始终允许"）
-  </Step>
-  <Step title="项目配置">
-    项目目录中的 `.claude/settings.json`，团队共享
-  </Step>
-  <Step title="用户全局配置">
-    `~/.claude/settings.json`，跨项目生效
-  </Step>
-  <Step title="托管设置">
-    企业管理员下发的策略，用户不可覆盖
-  </Step>
-  <Step title="默认规则">
-    系统内置的基线规则
-  </Step>
-</Steps>
-
-## 规则的匹配方式
-
-权限规则不是简单的"允许/禁止某个工具"，它支持丰富的匹配条件：
-
-- **工具名匹配**：`"tool": "Bash"` → 针对所有 Bash 命令
-- **命令模式匹配**：`"command": "git *"` → 只针对 git 开头的命令
-- **路径匹配**：`"path": "src/**"` → 只允许操作 src 目录下的文件
-- **组合条件**：以上条件可以组合使用
+| 行为 | 含义 | 返回类型 | 典型场景 |
+|------|------|---------|---------|
+| **Allow** | 自动放行，用户无感知 | `{ behavior: 'allow', updatedInput, decisionReason }` | Read 读取项目内文件 |
+| **Ask** | 弹出确认对话框 | `{ behavior: 'ask', message, suggestions, metadata }` | Bash 执行未知命令 |
+| **Deny** | 直接拒绝 | `{ behavior: 'deny', message, decisionReason }` | 尝试执行被禁止的命令 |
 
-## 权限模式
+这些行为由 `PermissionResult` 类型定义（`src/utils/permissions/PermissionResult.ts`）。
+
+## 权限规则的五层来源
+
+规则从 5 个来源汇聚（`PERMISSION_RULE_SOURCES`，`permissions.ts:109`），优先级从高到低：
+
+```
+1. session        — 用户在当前对话中手动授权（"Always allow"）
+2. cliArg         — 命令行 --allow/--deny 参数
+3. command        — Skill 工具的 allowedTools 白名单
+4. projectSettings — .claude/settings.json（团队共享）
+5. userSettings   — ~/.claude/settings.json（跨项目）
+6. policySettings — 企业管理员下发的策略（用户不可覆盖）
+```
+
+每个来源维护三个数组：`alwaysAllowRules[source]`、`alwaysAskRules[source]`、`alwaysDenyRules[source]`。
+
+规则数据结构为 `PermissionRule`：
+```typescript
+{
+  source: PermissionRuleSource      // 来自哪个层级
+  ruleBehavior: 'allow' | 'ask' | 'deny'
+  ruleValue: {
+    toolName: string                // 如 "Bash"、"mcp__server1"
+    ruleContent?: string            // 如 "git *"、"src/**"
+  }
+}
+```
+
+## 规则匹配引擎
+
+### 三维度匹配
+
+`permissions.ts` 实现了三种匹配维度：
+
+**1. 工具名匹配**（`toolMatchesRule()`，第 238 行）
+
+匹配整个工具，仅当规则没有 `ruleContent`：
+```typescript
+// 精确匹配
+rule "Bash" → 匹配 BashTool
+rule "mcp__server1" → 匹配该 MCP Server 的所有工具（server 级别）
+rule "mcp__server1__*" → 通配符匹配（同上）
+```
+
+MCP 工具使用 `getToolNameForPermissionCheck()` 获取匹配名称，支持有前缀（`mcp__server__tool`）和无前缀模式。
 
-系统提供几种预设的权限模式，适应不同信任级别：
+**2. 命令模式匹配**（BashTool 的 `checkPermissions()`）
 
-| 模式 | 适用场景 |
-|------|---------|
-| **Default** | 日常使用，敏感操作逐一确认 |
-| **Plan Mode** | 探索阶段，AI 只能读不能写 |
-| **Bypass** | 完全信任 AI，所有操作自动放行（需显式开启） |
+BashTool 通过 `preparePermissionMatcher()`（`Tool.ts:514`）解析命令模式：
+```json
+{"tool": "Bash", "ruleContent": "git *"}  → 匹配 "git commit -m 'fix'"
+```
 
-## Denial Tracking
+命令通过 AST 解析（`readOnlyValidation.ts` 使用 tree-sitter bash），提取第一个子命令进行匹配。
 
-系统不仅记录"允许了什么"，还追踪"拒绝了什么"：
+**3. 路径匹配**（文件工具的 `checkPermissions()`）
+
+Read/Edit/Write 工具通过 `getPath()` 提取文件路径，与 `ruleContent` 中的 glob 模式匹配：
+```json
+{"tool": "Edit", "ruleContent": "src/**"}  → 匹配 "src/utils/foo.ts"
+```
+
+### 权限检查的完整流程
+
+每次工具调用的权限检查（`canUseTool()` → `checkPermissions()`）经过以下步骤：
+
+```
+1a. Blanket deny 检查
+    getDenyRuleForTool() → 工具名完全匹配 deny 规则？
+    ↓ 命中 → deny（工具在 getTools() 阶段就被过滤掉）
+
+1b. Blanket allow 检查
+    toolAlwaysAllowedRule() → 工具名完全匹配 allow 规则？
+    ↓ 命中 → allow
+
+2. 工具自身 checkPermissions()
+    各工具有自定义逻辑：
+    - BashTool: readOnlyValidation → sandbox 判定 → AST 解析 → 模式匹配
+    - FileEditTool: 路径白名单检查
+    - SkillTool: safe properties 白名单 + 精确/前缀匹配
+    ↓ 返回 PermissionResult
+
+3. Hook 系统
+    executePermissionRequestHooks() → PreToolUse hook 可以 override
+    ↓ hook 返回 deny → deny
+    ↓ hook 返回 ask → 升级为 ask
+
+4. Ask 规则检查
+    getAskRules() → 命中 → ask
+
+5. 默认行为
+    根据当前 permissionMode 决定默认行为
+    - 'default': 大部分工具 ask
+    - 'plan': 写操作 deny，读操作 allow
+    - 'bypass': 全部 allow
+```
+
+## 权限模式
 
-- 如果 AI 被连续拒绝多次同一类操作，系统会调整策略
-- 这防止 AI 陷入"反复请求同一个被拒操作"的死循环
+| 模式 | `PermissionMode` 值 | 适用场景 | 行为 |
+|------|---------------------|---------|------|
+| **Default** | `'default'` | 日常使用 | 敏感操作逐一确认 |
+| **Plan Mode** | `'plan'` | 探索阶段 | 只能读不能写（`isReadOnly()` 检查） |
+| **Auto** | `'auto'` | 信任 AI | 通过 transcript classifier 自动决策 |
+| **Bypass** | `'bypassPermissions'` | 完全信任 | 所有操作自动放行（需显式 `--dangerously-skip-permissions`） |
+
+Plan Mode 切换由 `EnterPlanModeTool.call()` 触发：
+```typescript
+// EnterPlanModeTool.ts:88
+context.setAppState(prev => ({
+  ...prev,
+  toolPermissionContext: applyPermissionUpdate(
+    prepareContextForPlanMode(prev.toolPermissionContext),
+    { type: 'setMode', mode: 'plan', destination: 'session' },
+  ),
+}))
+```
+
+退出时由 `ExitPlanModeV2Tool` 恢复为之前的模式。
+
+## Denial Tracking：死循环防护
+
+`src/utils/permissions/denialTracking.ts` 实现了拒绝追踪机制：
+
+```typescript
+const DENIAL_LIMITS = {
+  maxDenialsPerTool: 3,        // 同一工具连续拒绝上限
+  cooldownPeriodMs: 30_000,    // 冷却期 30 秒
+}
+```
+
+当 AI 被连续拒绝同一类操作达到上限时：
+1. `recordDenial()` 记录拒绝，增加计数
+2. `shouldFallbackToPrompting()` 检测到连续拒绝，返回 true
+3. 系统向 AI 注入消息："Your previous tool call was rejected..."
+4. AI 被迫改变策略，避免"反复请求同一个被拒操作"的死循环
+
+操作成功时调用 `recordSuccess()` 重置计数。
+
+## 规则的运行时更新
+
+权限规则可以在运行时动态更新（`applyPermissionUpdate()`，`PermissionUpdate.ts`）：
+
+```typescript
+type PermissionUpdate =
+  | { type: 'addRule', behavior, rule, destination }
+  | { type: 'removeRule', behavior, rule, destination }
+  | { type: 'setMode', mode, destination }
+```
+
+当用户在 Ask 对话框中选择 "Always allow"，系统调用 `persistPermissionUpdates()` 将规则写入对应层级的 settings 文件（project/user/managed），同时更新内存中的 `toolPermissionContext`。

docs/safety/plan-mode.mdx

@@ -1,10 +1,10 @@
 ---
 title: "计划模式 - Plan Mode 先看后做的安全机制"
-description: "解析 Claude Code Plan Mode 设计：给 AI 一个只读探索阶段，先分析再执行，避免不可逆操作，让用户在 AI 行动前审查方案。"
-keywords: ["Plan Mode", "计划模式", "只读模式", "安全执行", "预览方案"]
+description: "基于源码解析 Claude Code Plan Mode 的完整实现：EnterPlanModeTool/ExitPlanModeV2Tool 的工具设计、权限上下文切换机制、Prompt-based 权限请求、计划文件持久化、Teammate 审批流程。"
+keywords: ["Plan Mode", "计划模式", "EnterPlanMode", "ExitPlanMode", "prepareContextForPlanMode", "allowedPrompts"]
 ---
 
-{/* 本章目标：解释 Plan Mode 的设计理念 */}
+{/* 本章目标：基于源码揭示 Plan Mode 的完整实现 */}
 
 ## 问题场景
 
@@ -12,50 +12,140 @@ keywords: ["Plan Mode", "计划模式", "只读模式", "安全执行", "预览
 
 ## Plan Mode 的解决方案
 
-计划模式给对话加了一个"只读阶段"：
+计划模式给对话加了一个"只读阶段"，通过两个工具实现闭环：
 
 <Steps>
-  <Step title="进入计划模式">
-    AI 自主判断任务需要规划（或用户主动触发），进入计划模式
+  <Step title="EnterPlanMode — 进入计划模式">
+    AI 自主判断（或用户触发）任务需要规划，调用 `EnterPlanModeTool`（`src/tools/EnterPlanModeTool/EnterPlanModeTool.ts:36`）。该工具需要**用户审批**（`checkPermissions` 返回 `ask`）。
   </Step>
-  <Step title="探索阶段">
-    在这个阶段，AI 只能使用读取和搜索类工具——不能编辑文件、不能执行命令
+  <Step title="探索阶段 — 只读工具集">
+    权限模式切换为 `'plan'`，AI 只能使用 `isReadOnly()` 为 true 的工具（Read、Grep、Glob、Agent 等）。写操作被自动拒绝。
   </Step>
-  <Step title="形成计划">
-    AI 把理解和方案写入计划文件，提交给用户审阅
+  <Step title="ExitPlanMode — 提交方案审批">
+    AI 完成探索后，调用 `ExitPlanModeV2Tool`（`src/tools/ExitPlanModeTool/ExitPlanModeV2Tool.ts:147`），将计划文件提交给用户审阅。这是第二个**需要用户审批**的节点。
   </Step>
-  <Step title="用户审批">
-    用户阅读计划，提出修改意见或直接批准
-  </Step>
-  <Step title="退出计划模式">
-    计划被批准后，AI 恢复全部工具权限，按计划执行
+  <Step title="恢复执行 — 全部工具权限">
+    用户批准后，权限模式恢复为进入前的状态，AI 按计划执行。
   </Step>
 </Steps>
 
 ## 权限的自动收窄与恢复
 
-计划模式的精妙之处在于**自动改变权限上下文**：
+### 进入：`prepareContextForPlanMode()`
+
+`EnterPlanModeTool.call()`（第 77 行）的核心逻辑：
+
+```typescript
+// 1. 记录转换状态（保存之前的模式）
+handlePlanModeTransition(currentMode, 'plan')
+
+// 2. 切换权限上下文为 plan 模式
+context.setAppState(prev => ({
+  ...prev,
+  toolPermissionContext: applyPermissionUpdate(
+    prepareContextForPlanMode(prev.toolPermissionContext),
+    { type: 'setMode', mode: 'plan', destination: 'session' },
+  ),
+}))
+```
+
+`prepareContextForPlanMode()`（`src/utils/permissions/permissionSetup.ts`）做了什么：
+- 创建新的 `ToolPermissionContext`，`mode` 设为 `'plan'`
+- 在 plan 模式下，工具的 `isReadOnly()` 检查成为唯一准入条件
+- 如果用户的默认模式是 `'auto'`，还会激活 classifier 的副作用
+
+### 退出：权限恢复 + Prompt-based 权限
+
+`ExitPlanModeV2Tool` 的退出逻辑做了两件关键的事：
+
+**1. 恢复权限模式**
+
+通过 `handlePlanModeTransition()` 和 `applyPermissionUpdate()` 恢复到进入前的模式。
+
+**2. 注入 Prompt-based 权限**
+
+这是 Plan Mode 最精妙的设计——AI 可以在计划中声明它需要执行的命令类别：
 
-- 进入时：系统自动保存当前权限模式，切换为"只读"
-- 退出时：系统自动恢复之前的权限模式
+```typescript
+// ExitPlanModeV2Tool 的 inputSchema
+allowedPrompts: z.array(z.object({
+  tool: z.enum(['Bash']),
+  prompt: z.string().describe('Semantic description, e.g. "run tests"'),
+})).optional()
+```
 
-AI 和用户都不需要手动调整权限设置。
+当 AI 提交计划时，如果声明了 `allowedPrompts: [{ tool: 'Bash', prompt: 'run tests' }]`，用户批准后，"run tests" 这类 Bash 命令会被自动放行——不再需要逐个确认。
+
+## 计划文件的持久化
+
+计划内容被写入磁盘文件（由 `getPlanFilePath()` 确定路径），这与简单的"AI 说一段话然后开始执行"有本质区别：
+
+1. `ExitPlanModeV2Tool` 的 `normalizeToolInput` 从磁盘读取计划内容，注入到 `input.plan` 和 `input.planFilePath`
+2. 计划文件是用户**可编辑**的——用户可以在审批前修改 AI 的方案
+3. `planWasEdited` 字段标记用户是否修改了计划，影响后续的 tool_result 回显
+4. `persistFileSnapshotIfRemote()` 在远程场景下保存文件快照
+
+## Teammate 场景下的计划审批
+
+在 Agent Swarms（`isAgentSwarmsEnabled()`）模式下，计划审批有额外的协作流程：
+
+```typescript
+// 如果是 Teammate 角色
+if (isTeammate()) {
+  // 发送计划到 Team Leader 的 mailbox 等待审批
+  const requestId = generateRequestId()
+  writeToMailbox(getTeamName(), {
+    type: 'plan_approval_request',
+    plan, requestId, ...
+  })
+  // 返回 awaitingLeaderApproval: true
+  // Team Leader 审批后通过 mailbox 通知 Teammate
+}
+```
+
+这意味着在蜂群模式下，计划可能不是由直接用户审批，而是由 Team Leader 审批。
 
 ## 什么时候该用计划模式
 
-| 场景 | 是否需要计划 |
-|------|-------------|
-| 修复一个明确的 typo | 不需要，直接修 |
-| 添加一个简单的函数 | 不需要 |
-| 重构一个大模块 | 需要——先搞清楚影响范围 |
-| 涉及多个文件的 feature | 需要——先统一方案 |
-| 不确定该怎么做 | 需要——让 AI 先调研 |
+`EnterPlanModeTool` 的 Prompt（`src/tools/EnterPlanModeTool/prompt.ts`）定义了两套触发标准——外部版本更积极（鼓励规划），内部版本更克制（仅在真正模糊时使用）：
+
+| 场景 | 外部版本 | 内部版本 |
+|------|---------|---------|
+| 修复 typo | 跳过 | 跳过 |
+| 添加删除按钮 | **进入**（涉及多个文件） | **跳过**（路径明确） |
+| 重构认证系统 | **进入** | **进入**（高影响重构） |
+| "开始做 X" | — | **跳过**（直接开始） |
+| 架构决策（Redis vs 内存缓存） | **进入** | **进入**（真正模糊） |
 
 ## 计划模式 + 任务系统
 
 计划模式通常与任务系统配合使用：
 
-1. 在计划模式中，AI 把实施步骤创建为任务列表
+1. 在计划模式中，AI 把实施步骤创建为任务列表（`TodoWrite`）
 2. 用户审批计划（包含任务列表）
 3. 退出计划模式后，AI 按任务列表逐项执行
 4. 用户可以通过任务列表追踪进度
+
+## 完整生命周期
+
+```
+用户: "重构这个模块"
+  ↓
+AI 判断需要规划 → 调用 EnterPlanModeTool
+  ↓ 用户审批（Ask 对话框）
+handlePlanModeTransition(default, 'plan')  // 保存 default
+prepareContextForPlanMode()                // 创建只读上下文
+  ↓
+AI 使用 Read/Grep/Glob/Agent 探索代码库
+  ↓ （可能 10+ 轮只读工具调用）
+AI 形成方案 → 调用 ExitPlanModeV2Tool({
+  allowedPrompts: [
+    { tool: 'Bash', prompt: 'run tests' },
+    { tool: 'Bash', prompt: 'install dependencies' }
+  ]
+})
+  ↓ 用户审批计划（可编辑计划文件）
+恢复权限模式 → 注入 prompt-based 权限
+  ↓
+AI 使用全部工具执行计划，"run tests" 等命令自动放行
+```

docs/tools/what-are-tools.mdx

@@ -1,10 +1,10 @@
 ---
 title: "工具系统设计 - AI 如何从说到做"
-description: "深入理解 Claude Code 的 Tool 抽象设计。每个工具是标准化的能力单元，包含名称、描述、输入 Schema 和执行函数。了解工具注册与调用机制。"
-keywords: ["工具系统", "Tool 抽象", "AI 工具", "function calling", "工具调用"]
+description: "深入理解 Claude Code 的 Tool 抽象设计：从类型定义、注册机制、调用链路到渲染系统，揭示 50+ 内置工具如何通过统一的 Tool 接口协同工作。"
+keywords: ["工具系统", "Tool 抽象", "AI 工具", "function calling", "buildTool", "getTools"]
 ---
 
-{/* 本章目标：让读者理解 Tool 抽象的设计思想 */}
+{/* 本章目标：基于 src/Tool.ts 和 src/tools.ts 揭示工具系统的完整架构 */}
 
 ## AI 为什么需要工具
 
@@ -14,33 +14,161 @@ keywords: ["工具系统", "Tool 抽象", "AI 工具", "function calling", "工
 
 工具是 AI 的双手。AI 说"我想读这个文件"，工具系统替它真正去读；AI 说"我想执行这条命令"，工具系统替它真正去跑。
 
-## 一个工具长什么样
+## Tool 类型：35 个字段的统一接口
+
+所有工具都实现 `src/Tool.ts:362` 的 `Tool<Input, Output, Progress>` 类型。这不是一个 class，而是一个包含 35+ 字段的**结构化类型**（structural typing），任何满足该接口的对象就是一个工具：
+
+### 核心四要素
+
+| 字段 | 类型 | 说明 |
+|------|------|------|
+| `name` | `string` | 唯一标识（如 `Read`、`Bash`、`Agent`） |
+| `description()` | `(input) => Promise<string>` | **动态描述**——根据输入参数返回不同描述（如 `Execute skill: ${skill}`） |
+| `inputSchema` | `z.ZodType` | Zod schema，定义参数类型和校验规则 |
+| `call()` | `(args, context, canUseTool, parentMessage, onProgress?) => Promise<ToolResult<Output>>` | 执行函数 |
 
-每个工具都是一个标准化的"能力单元"，包含四个要素：
+### 注册与发现
+
+| 字段 | 说明 |
+|------|------|
+| `aliases` | 别名数组（向后兼容重命名） |
+| `searchHint` | 3-10 词的短语，供 ToolSearch 关键词匹配（如 `"jupyter"` for NotebookEdit） |
+| `shouldDefer` | 是否延迟加载（配合 ToolSearch 按需加载） |
+| `alwaysLoad` | 永不延迟加载（如 SkillTool 必须在 turn 1 可见） |
+| `isEnabled()` | 运行时开关（如 PowerShellTool 检查平台） |
+
+### 安全与权限
+
+| 字段 | 说明 |
+|------|------|
+| `validateInput()` | 输入校验（在权限检查之前），返回 `ValidationResult` |
+| `checkPermissions()` | 权限检查（在校验之后），返回 `PermissionResult` |
+| `isReadOnly()` | 是否只读操作（影响权限模式） |
+| `isDestructive()` | 是否不可逆操作（删除、覆盖、发送） |
+| `isConcurrencySafe()` | 相同输入是否可以并行执行 |
+| `preparePermissionMatcher()` | 为 Hook 的 `if` 条件准备模式匹配器 |
+| `interruptBehavior()` | 用户中断时的行为：`'cancel'` 或 `'block'` |
+
+### 输出与渲染
+
+| 字段 | 说明 |
+|------|------|
+| `maxResultSizeChars` | 结果字符上限（超出则持久化到磁盘，如 `100_000`） |
+| `mapToolResultToToolResultBlockParam()` | 将 Output 映射为 API 格式的 `ToolResultBlockParam` |
+| `renderToolResultMessage()` | React 组件渲染工具结果到终端 |
+| `renderToolUseMessage()` | React 组件渲染工具调用过程 |
+| `backfillObservableInput()` | 在不破坏 prompt cache 的前提下回填可观察字段 |
+
+### 上下文与 Prompt
+
+| 字段 | 说明 |
+|------|------|
+| `prompt()` | 返回该工具的详细使用说明，注入到 System Prompt |
+| `outputSchema` | 输出 Zod schema（用于类型安全的结果处理） |
+| `getPath()` | 提取操作的文件路径（用于权限匹配和 UI 显示） |
+
+## 工具注册：`getTools()` 的分层组装
+
+`src/tools.ts` 的 `getAllBaseTools()`（第 191 行）是工具注册的核心：
+
+```
+固定工具（始终可用）:
+  AgentTool, BashTool, FileReadTool, FileEditTool, FileWriteTool,
+  NotebookEditTool, WebFetchTool, WebSearchTool, TodoWriteTool,
+  AskUserQuestionTool, SkillTool, EnterPlanModeTool, ExitPlanModeV2Tool,
+  TaskOutputTool, BriefTool, ListMcpResourcesTool, ReadMcpResourceTool
+
+条件工具（运行时检查）:
+  ← hasEmbeddedSearchTools()  ? []       : [GlobTool, GrepTool]
+  ← isTodoV2Enabled()         ? V2 Tasks  : []
+  ← isWorktreeModeEnabled()   ? Worktree  : []
+  ← isAgentSwarmsEnabled()    ? Teams     : []
+  ← isToolSearchEnabled()     ? ToolSearch: []
+  ← isPowerShellToolEnabled() ? PowerShell: []
+
+Feature-flag 工具:
+  ← feature('COORDINATOR_MODE') ? [coordinatorMode tools]
+  ← feature('KAIROS')           ? [SleepTool, SendUserFileTool, ...]
+  ← feature('WEB_BROWSER_TOOL') ? [WebBrowserTool]
+  ← feature('HISTORY_SNIP')     ? [SnipTool]
+
+Ant-only 工具:
+  ← process.env.USER_TYPE === 'ant' ? [REPLTool, ConfigTool, TungstenTool]
+```
+
+`getTools()`（第 269 行）在 `getAllBaseTools()` 基础上应用权限过滤：
+
+```typescript
+export const getTools = (permissionContext): Tools => {
+  const base = getAllBaseTools()
+  // 过滤 blanket deny 规则命中的工具
+  return filterToolsByDenyRules(base, permissionContext)
+}
+```
+
+**关键设计**：工具列表在每次 API 调用时组装（而非全局缓存），因为 `isEnabled()` 的结果可能随运行时状态变化。
+
+## `buildTool()` 工厂函数
+
+大多数工具通过 `buildTool()` 创建（`src/Tool.ts:721`），它是一个类型安全的构造器：
+
+```typescript
+export const BashTool: Tool<...> = buildTool({
+  name: 'Bash',
+  inputSchema: lazySchema(() => z.object({command: z.string(), ...})),
+  // ...其他字段
+}) satisfies ToolDef<Input, Output, Progress>
+```
+
+`satisfies ToolDef` 确保编译时类型检查，`lazySchema` 延迟 Zod schema 解析（避免循环依赖）。
+
+## 工具调用的完整链路
+
+从 AI 发出 `tool_use` 到结果回传，经过以下步骤：
+
+```
+1. API 返回 tool_use block（包含 name + input）
+   ↓
+2. StreamingToolExecutor.addTool() / runTools()
+   ↓
+3. findToolByName() 查找工具
+   ↓
+4. validateInput() — 输入校验
+   ↓ 失败 → 返回错误 tool_result
+5. canUseTool() — 权限 UI（Ask 模式下弹确认）
+   ↓ 拒绝 → 返回拒绝 tool_result
+6. checkPermissions() — 规则匹配
+   ↓
+7. call() — 执行实际操作
+   ↓ onProgress() 回调实时更新 UI
+8. 返回 ToolResult<Output>
+   ↓
+9. mapToolResultToToolResultBlockParam() — 转为 API 格式
+   ↓
+10. 新消息追加到对话 → 进入下一轮迭代
+```
 
-| 要素 | 说明 | 示例（FileRead 工具） |
-|------|------|----------------------|
-| **名称** | 工具的唯一标识 | `Read` |
-| **描述** | 告诉 AI 这个工具能做什么（AI 据此决定是否使用） | "读取本地文件系统中的文件" |
-| **参数定义** | 工具接受什么输入 | `file_path`（必填）、`offset`、`limit` |
-| **执行逻辑** | 工具被调用时实际做什么 | 读取文件内容并返回 |
+## 工具结果的预算控制
+
+每个工具通过 `maxResultSizeChars` 声明输出上限：
+
+- **BashTool**：`30_000`（命令输出）
+- **SkillTool**：`100_000`（技能执行结果）
+- **FileReadTool**：`Infinity`（文件内容不走持久化，避免 Read→file→Read 循环）
 
-## AI 如何选择工具
+超出上限的结果被 `applyToolResultBudget()`（`src/utils/toolResultStorage.ts`）持久化到磁盘，AI 只收到预览 + 文件路径。
 
-AI 不是从下拉菜单里选工具——它是根据**工具描述**和**当前任务**自主决策的：
+## MCP 工具的扩展
 
-1. 系统把所有可用工具的名称、描述、参数告诉 AI
-2. AI 在思考过程中决定"我需要用某个工具"
-3. AI 生成一个结构化的工具调用请求（工具名 + 参数）
-4. 系统执行工具，将结果返回给 AI
+MCP Server 提供的工具通过 `mcpInfo` 字段标记来源：
+
+```typescript
+mcpInfo?: { serverName: string; toolName: string }
+```
 
-<Note>
-工具描述的质量直接影响 AI 的决策准确性。一段好的描述不仅说明"能做什么"，还说明"什么时候该用、什么时候不该用"。
-</Note>
+MCP 工具的 `inputJSONSchema` 直接使用 JSON Schema（而非 Zod），因为 schema 来自远程协议。它们通过 `filterToolsByDenyRules()` 支持 `mcp__server` 前缀的 blanket deny 规则。
 
-## 50+ 内置工具
-
-Claude Code 内置了覆盖软件开发全流程的工具集：
+## 50+ 内置工具全景
 
 <CardGroup cols={3}>
   <Card title="文件操作" icon="file">
@@ -53,23 +181,26 @@ Claude Code 内置了覆盖软件开发全流程的工具集：
     Agent / SendMessage / AskUserQuestion
   </Card>
   <Card title="任务追踪" icon="list-check">
-    TaskCreate / TaskUpdate / TaskList / TaskGet
+    TaskCreate / TaskUpdate / TaskList / TaskGet / TaskOutput / TaskStop
   </Card>
   <Card title="Web 能力" icon="globe">
-    WebFetch / WebSearch
+    WebFetch / WebSearch / WebBrowser
   </Card>
   <Card title="规划与版本" icon="map">
-    EnterPlanMode / Worktree / TodoWrite
+    EnterPlanMode / ExitPlanMode / Worktree / TodoWrite / ToolSearch
   </Card>
 </CardGroup>
 
 ## 工具的可视化渲染
 
-工具不仅能"做事"，还能"展示"。每个工具可以定义自己的 UI 渲染方式：
+工具不仅能"做事"，还能"展示"。每个工具通过 React 组件定义 UI 渲染：
 
-- **FileEdit** → 在终端里展示语法高亮的 diff 视图
-- **Bash** → 实时显示命令输出，带进度指示
+- **FileEdit** → `renderToolResultMessage` 展示语法高亮的 diff 视图
+- **Bash** → 实时显示命令输出（通过 `onProgress` 回调），带进度指示
 - **Grep** → 高亮匹配结果，显示文件路径和行号链接
 - **Agent** → 显示子 Agent 的进度条和状态
+- **SkillTool** → 渲染技能执行进度
+
+`isSearchOrReadCommand()` 允许工具声明自己是搜索/读取操作，触发 UI 的折叠显示模式（避免大量搜索结果占满屏幕）。
 
-这让用户能直观地看到"AI 在做什么、做到哪了"。
+`getActivityDescription()` 为 spinner 提供活动描述（如 "Reading src/foo.ts"、"Running bun test"），替代默认的工具名显示。